新京報訊(記者王卡拉)壁虎斷尾重生,蠑螈大腦自愈……我們常感嘆人類為什么沒有這樣的“超能力”?其實,在哺乳動物中,像兔子、山羊等也具備一定的再生能力。而人類、小鼠這類高等哺乳動物受傷后,往往只能結(jié)疤愈合,無法“原裝”再生。為什么高等哺乳動物在進化過程中丟失了這些能力?這是生物學(xué)界的一大謎題。


科學(xué)家們在小鼠和兔子的“耳朵”上找到了關(guān)鍵線索。近日,北京華大生命科學(xué)研究院聯(lián)合北京生命科學(xué)研究所,基于華大自主研發(fā)的時空組學(xué)技術(shù)Stereo-seq和高通量測序平臺DNBSEQ-Tx系列,首次發(fā)現(xiàn)Aldh1a2基因的表達不足導(dǎo)致的視黃酸合成不足,是高等哺乳動物小鼠耳廓再生失敗的核心機制。在激活該基因后,小鼠耳廓實現(xiàn)再生。這為深入理解進化過程中哺乳動物的再生能力丟失提供了新的見解,并為再生醫(yī)學(xué)和人類受損器官的重建與再生提供了重要靶標。


《科學(xué)》官網(wǎng)截圖


研究團隊選取了哺乳動物特有器官耳廓(外耳)為研究模型,基于單細胞RNA測序和華大自主研發(fā)的時空組學(xué)技術(shù)Stereo-seq,描繪了可再生物種(兔子)與不可再生物種(小鼠)耳廓損傷后再生/修復(fù)的高分辨率單細胞時空動態(tài)過程,逐時逐步觀察傷口處每個細胞類型的變化和基因表達動態(tài),精確對比再生過程和普通愈合過程有何不同。

結(jié)果發(fā)現(xiàn),小鼠耳廓再生失敗與視黃酸合成不足有關(guān)。視黃酸是維生素A的一種代謝產(chǎn)物,與細胞發(fā)育密切相關(guān)。而小鼠視黃酸不足主要是因為視黃酸合成限速酶Aldh1a2的表達不足,以及視黃酸本身的降解加速。


為什么小鼠的Aldh1a2基因表達會不足呢?科研團隊通過進化生物學(xué)比較發(fā)現(xiàn),在兔子的基因組中,保留了負責(zé)調(diào)控Aldh1a2基因的一些關(guān)鍵DNA序列。這些調(diào)控序列被稱為“增強子”,可以理解為基因表達的開關(guān)或加速器。研究人員在兔子Aldh1a2基因附近發(fā)現(xiàn)了6個活躍的增強子(AE1-AE6),其中有兩個增強子(AE1和AE5)在耳廓受傷再生時會被強烈激活,相當(dāng)于在兔子受傷后及時按下“開關(guān)”,大大提高了Aldh1a2的表達,在兔子傷口處源源不斷地產(chǎn)生視黃酸,幫助組織再生。


可惜的是,研究團隊僅在小鼠對應(yīng)的基因區(qū)域找到了1個活性增強子(AE3),其他與再生相關(guān)的調(diào)控元件都已失活。換句話說,小鼠體內(nèi)調(diào)控Aldh1a2基因的“按鈕”大都消失了,受傷后想要大幅度開啟Aldh1a2基因表達非常困難。這一進化差異解釋了為什么小鼠耳廓受傷后Aldh1a2“叫不醒”、視黃酸產(chǎn)量提不高,從而無法像兔子那樣再生組織。


如果人為按下這些丟失的“開關(guān)”,是否就能讓失去再生能力的動物實現(xiàn)再生呢?研究團隊進行了探索:他們嘗試直接激活A(yù)ldh1a2基因或外源補充視黃酸,發(fā)現(xiàn)都可以使本不具備再生能力的成年小鼠耳廓傷口,出現(xiàn)了多能性細胞(成纖維細胞),從而重建了耳廓的軟骨與神經(jīng)組織。也就是說,小鼠耳朵的傷口不再只是簡單結(jié)疤,而是實現(xiàn)了再生。


此外,研究團隊還將兔子的增強子AE1導(dǎo)入小鼠的基因組,結(jié)果發(fā)現(xiàn),受傷后的小鼠耳廓Aldh1a2基因表達顯著提高,視黃酸增加,耳廓的再生能力也得到明顯提升。


總而言之,研究團隊基于單細胞時空組技術(shù)以及跨物種進化比較,系統(tǒng)描繪了器官損傷后,可再生物種與不可再生物種的細胞組成變化以及基因表達的時空動態(tài)變化,全面揭示了高等哺乳動物器官再生能力丟失的機制,為探索人類受損器官的重建與再生提供了重要靶標和理論依據(jù)。


相關(guān)成果發(fā)表于國際頂級學(xué)術(shù)期刊《科學(xué)》(Science)。北京生命科學(xué)研究所林煒鋒博士研究生、賈小慧博士研究生,北京華大生命科學(xué)研究院副研究員石小峰,西北農(nóng)林科技大學(xué)副教授赫秋亞,北京華大生命科學(xué)研究院助理研究員張盼玉為論文共同第一作者。北京生命科學(xué)研究所研究員王偉、北京華大生命科學(xué)研究院研究員鄧子卿和西北農(nóng)林科技大學(xué)教授羅軍為論文共同通訊作者。該研究得到了國家重點研發(fā)計劃項目的資助,也獲得了北京生命科學(xué)研究所倫理審查委員會和華大科技倫理委員會的批準。


校對 劉軍